Устройства Аквадиск были созданы в 1999 году на базе Межрегиональной общественной организации содействия научным исследованиям и изобретениям по проблемам водопользования «Диалог»

В 2000 году – началась серия экспериментов в Аналитическом Центре химического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова. Серия экспериментов продолжались до 2003 года.

2001 год получен первый сертификат в Федеральном Центре Госсанэпиднадзора Минздрава России.

2002 год получены патенты: «Способ передачи и записи энергоинформационных потоков на вещество или комбинацию веществ» и свидетельство на полезную модель. В этом же году Аквадиск стал победителем конкурса «Экологическая безопасная продукция» на международной выставке в Москве и был награжден золотой медалью. Проводятся переговоры с рядом крупных инвесторов о наладке промышленного выпуска продукции Аквадиск

2003 создается компания ОАО «Аква-Система». Начинает работать лаборатория по исследованию кристаллов замороженной воды, разработан собственный термодинамический равновесный процесс управления замораживанием исследуемой воды для получения кристаллов. Появляется фирменный стиль компании ОАО «Аква-Система» и девиз «Родниковая вода в вашем доме». Аквадиск получает второй сертификат в Федеральном Центре Госсанэпиднадзора Минздрава России. Аквадиск учувствует на VI международном салоне промышленной собственности «Архимед-2003», где получает серебряную медаль.

2004 год проводится ряд крупных исследований в различных сферах народного хозяйства РФ. Наша продукция начинает экспортироваться в Европейские страны и США. Появляется региональная сеть на территории Российской федерации. Успешно стартует проект по продаже различных устройств Аквадиск через всемирную сеть Интернет. В Ноябре 2004 года Аквадиск завоевывает золотую медаль на 53-м Всемирном Салоне инноваций, научных исследований и новых технологий «Брюссель-Эврика».

2005 год ОАО «Аква-Система» заливает лед на проходящем Чемпионате мира по конькобежному спорту в Крылатском. Проводятся первые исследования с кишечной палочкой. Получен патент на проточный вариант «Аквадиск-проточный». Запущен в серию «Аквадиск-Проточный».